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昆士兰医学基因组学中心选用SGI® LiveArc® 数字化资产管理套件,以加速生命科学研究

2010-08-05 10:49
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加州FREMONT和澳大利亚布里斯班--(美国商业资讯)--HPC和数据中心解决方案的全球领导者 SGI 公司(NASDAQ:SGI)今天宣布,昆士兰大学的昆士兰医学基因组学中心(QCMG)已选用SGI® LiveArc® 储存解决方案来提升其储存、管理和处理人类癌症基因组序列数据的能力。该项目将有助于定位导致癌症的基因改变、更深入了解这些癌症,并有望协助战胜癌症。

QCMG 选用LiveArc旨在解决海量数据追踪并与临床信息进行关联的问题。自2010年1月部署 LiveArc解决方案以来,QCMG已发布了2个癌症基因组序列。QCMG的目标是在今后12个月完成30例患者基因组、转录组和表观基因组的测序,最终探明见于及导致胰腺癌和卵巢癌的基因改变。该中心隶属于国际肿瘤基因组协作组(ICGC),ICGC是一项全球性协作课题,旨在对25,000例个体中50种不同类型人类肿瘤进行测序。

QCMG高级生物信息学经理John Pearson说:"QCMG选用SGI公司的 LiveArc的原因在于该系统最适合部署Applied Biosystems公司的Bioscope生物信息学套件。SGI公司的本土支持程度也是其技术入选的重要因素。"

LiveArc用于管理元数据和工作流程处理。它包括:吸纳来自11台基因组测序仪每周生成的超过1 TB的未定位数据资产,将本地储存的数据资产复制到易于调用、可长期储存的大学数据库中,发送原始数据并采用SGI公司的高性能计算(HPC)和储存系统进行处理,管理所生成的二级和三级数据集。其硬件架构由75 TB的高速暂用存储器和SGI公司用于等级储存管理的数据迁移设施(DMF)组成。暂用存储器的输入/输出带宽性能设计为3GB/秒,并有高水平的同步输入-输出运算速率(IOPS)来支持分析和数据处理应用所需的输入/输出处理水平。

SGI公司亚太及日本区总经理兼副总裁Philip Chua说:"QCMG是南半球最大的基因组测序设施,SGI公司独特的技术专长和产品能够为QCMG至关重要的研究带来显著的生产力优势。采用SGI公司的LiveArc的研究组织是一个成熟的圈子,QCMG加入到其中将大幅改善自身的工作流程和研究数据追踪。"

关于 SGI公司

SGI公司是大规模集群计算、高性能储存、HPC和数据中心可实施性和服务的全球领导者。SGI公司专注于帮助客户克服最严厉的业务及技术挑战。进一步信息,请访问http://www.sgi.com.。

LiveArc是SGI公司与澳大利亚Arcitecta Pty. Ltd.的合作开发成果,与SGI公司的InfiniteStorage 解决方案一起销售。

关于昆士兰医学基因组学中心

昆士兰医学基因组学中心(QCMG)是由澳大利亚国立卫生与医学研究委员会(NHMRC)、昆士兰州政府和昆士兰大学(UQ)资助建立的。该中心的旗舰课题是500个胰腺癌和卵巢癌的基因组测序,该课题是国际肿瘤基因组协作组(ICGC)的组成部分。澳大利亚对 ICGC的承诺促成了这一世界级测序中心的创立,该中心设在昆士兰大学的分子生物科学研究所(IMB)内。QCMG目前雇佣了30多位分子生物学研究科学家和生物信息科学家,致力于医学基因组研究。进一步信息,请访问www.qcmg.org

© 2010 SGI. SGI 和LiveArc是of Silicon Graphics International Corp.或其分支机构在美国和/或其他国家的注册商标或商标。其他所有商标分别是其相应权益人的财产。

 

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