英國,劍橋&西雅圖--(美國商業資訊)-- Wellcome Sanger Institute、Parse Biosciences和Helmholtz Munich的運算科學中心 (Computational Health Center) 今天宣布一項奠定單細胞圖譜基礎的合作計畫,投注心力了解並闡明癌症可塑性對治療的反應。這場合作可開啟下一個雄心勃勃的階段,完成數億個細胞的癌症可塑性圖譜。
這場合作打算利用新式類器官擾動和人工智慧平台建立一套完整的資料集,促進發展基礎藥物開發模型和癌症研究。
Sanger Institute團隊主任Mathew Garnett博士與Helmholtz Munich運算科學中心主任兼Sanger Institute副研究員Fabian Theis教授將是這場合作的主要研究人員。
Garnett的研究團隊已造出出新型3D類器官培養物為高度可擴展的有效癌症模型,能夠捕捉患者的腫瘤特徵。該團隊將利用大量的此類腫瘤類器官(培養皿中的微型腫瘤)為模型,進一步了解癌症對治療的反應之可塑性和適應性機制。
Theis的研究團隊以開拓性的運算演算法解決人工智慧和單細胞基因體學交叉領域的複雜生物學挑戰,在這個背景下為藥物對細胞系統的效果進行電腦模擬成績有目共睹。是項合作將在Parse Biosciences的GigaLab進行。GigaLab是一座尖端設施,專用於以前所未有的速度大規模生成單細胞RNA定序資料集。
除了從這等規模的資料集中分析並發現見解所需的運算方法之外,Sanger、Helmholtz Munich和Parse團隊也已開發出自動化辦法來簡化實驗室流程。
這次合作的最終目標是建立單細胞參考圖以進行虛擬細胞建模,還可能有助於預測藥物對癌症患者的效果:像是可能如何產生抗藥性、來自哪些化合物以及找出未來治療工作的靶向。
Wellcome Sanger Institute團隊主任兼合作共同主持人Garnett說:「我們已經開發出一座變革性平台,可進行大規模類器官篩選以及生成並分析下游資料,有潛力重新認識癌症對治療的反應。我們的目標是建立一個集中學界和業界最優秀專才的社群來推動該計畫。如此規模的研究對於基礎模型的開發至關重要,有助於我們進一步理解癌症如何擴大,幫助這個領域取得迫切需要的進展。」
Helmholtz Munich運算科學中心主任兼合作共同主持人Theis說:「由於人工智慧的最新發展,我們距離建立虛擬細胞擾動模型的夢想越來越近。但為了高效擴大規模,我們需要大量高品質的單細胞擾動資料集。這次合作讓我們得以用這種規模進行研究,我很高興能夠幫助藥物研發領域邁向人工智慧驅動的實驗設計。」
Parse Biosciences技術長Charlie Roco博士表示:「我們很高興能與這些高瞻遠數的合作夥伴分享GigaLab的強大功能。GigaLab充分利用Parse的Evercode化學技術,能夠快速產生大型單細胞資料集,而且品質驚人。結合Wellcome Sanger Institute以及Helmholtz Munich的專業知識與GigaLab的速度和規模,將有機會徹底改變我們對癌症的認識。」
關於Parse Biosciences
Parse Biosciences是一家全球性的生物科學公司,其使命是加速人類健康和科學研究的進展。該公司助力研究人員,使他們能以前所未有規模和便利進行單細胞定序。其開創性方法已為癌症治療、組織修復、幹細胞治療、腎臟和肝臟疾病、大腦發育和免疫系統貢獻了突破性的發現。
Parse的成立緣起於共同創辦人Alex Rosenberg和Charles Roco在華盛頓大學開發的技術。Parse現已籌募了逾一億美元的資金,其技術廣受全球2500多個客戶採用。該公司不斷成長的產品組合包括Evercode™ Whole Transcriptome、Evercode™ TCR、Evercode™ BCR、Gene Select以及資料分析解決方案Trailmaker™。
Parse Biosciences位於西雅圖朝氣蓬勃的南聯合湖區 (South Lake Union),不久前才擴張,為一座新總部和先進實驗室揭幕。如欲了解進一步詳情,請造訪: https://www.parsebiosciences.com/ 。
關於Helmholtz Munich
一流生物醫學研究中心Helmholtz Munich的使命是為迅速轉變的世界開發突破性解決方案,改善人體健康。其跨學科研究團隊專注於環境誘發的疾病,尤其是糖尿病、肥胖、過敏和慢性肺部疾病的治療和預防。借助人工智慧和生物工程的力量,研究人員可以加速將研究成果轉化為可實際嘉惠患者的療法。Helmholtz Munich擁有約2500名員工,總部位於慕尼黑/Neuherberg。它是Helmholtz Association的成員,擁有超過43,000名員工和18個研究中心,是德國最大的科學組織。如欲進一步認識Helmholtz Munich (Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt GmbH),請見:www.helmholtz-munich.de/en
關於Wellcome Sanger Institute
Wellcome Sanger是獨步全球的基因體學研究中心。我們進行建構生物學和醫學知識基礎的大型研究。我們秉持開放合作的信念;我們與全球共享資料、成果、工具和技術,以推動科學發展。我們目光遠大,接受其他任何機構都無法完成的專案。我們利用基因體定序的力量來理解和利用DNA中的資料。我們在Wellcome的資助下,以充分的自由度和支援來突破基因體學的界限。我們的研究成果用於改善健康、認識地球上的生命。如欲了解進一步資訊,請造訪:www.sanger.ac.uk,或是在Twitter、Facebook、LinkedIn和我們的部落格上追蹤我們。
關於Wellcome
Wellcome支援科學研究、解決迫在眉睫的公眾健康挑戰。我們協助生命、健康和福祉方面的相關開發研究,並一肩挑起全球三大健康課題:心理健康、傳染病、氣候與健康。https://wellcome.org/
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