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昆士蘭醫學基因組學中心選用SGI® LiveArc® 數位化資產管理套件,以加速生命科學研究

2010-08-05 10:50
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加州FREMONT和澳洲布里斯本--(美國商業資訊)--HPC和資料中心解決方案的全球領導廠商 SGI 公司 (NASDAQ:SGI) 今天宣佈,昆士蘭大學的昆士蘭醫學基因組學中心 (QCMG) 已選用SGI® LiveArc® 儲存解決方案來提升其儲存、管理和處理人類癌症基因組序列資料的能力。該專案將有助於定位導致癌症的基因改變、更深入瞭解這些癌症,並可望協助戰勝癌症。

QCMG 選用LiveArc旨在解決大量資料追蹤並與臨床資訊進行關聯的問題。自2010年1月部署 LiveArc解決方案以來,QCMG已發佈了2個癌症基因組序列。QCMG的目標是在今後12個月完成30例患者基因組、轉錄組和表觀基因組的測序,最終探明見於及導致胰腺癌和卵巢癌的基因改變。該中心隸屬於國際癌症基因組聯合體 (ICGC),ICGC是一項全球性協作課題,旨在對25,000例個體中50種不同類型人類腫瘤進行測序。

QCMG資深生物資訊學經理John Pearson表示:「QCMG選用SGI公司的 LiveArc的原因在於該系統最適合部署Applied Biosystems公司的Bioscope生物資訊學套件。SGI公司的本土支援程度也是其技術入選的重要因素。」

LiveArc用於管理中繼資料和工作流程處理。它包括:吸納來自11台基因組測序儀每週產生的超過1 TB的未定位資料資產,將本地儲存的資料資產複製到易於調用、可長期儲存的大學資料庫中,傳遞原始資料並採用SGI公司的高速計算 (HPC) 和儲存系統進行處理,管理所產生的二級和三級資料集。其硬體架構由75 TB的高速暫用儲存器(scratch storage)和SGI公司用於階層儲存管理的資料遷移設施 (DMF) 組成。暫用用儲存器的輸入/輸出頻寬效能設計為3GB/秒,並有高水準的同步輸入-輸出運算速率 (IOPS) 來支援分析和資料處理應用所需的輸入/輸出處理水準。

SGI公司亞太及日本區總經理兼副總裁Philip Chua表示:「QCMG是南半球最大的基因組測序設施,SGI公司獨特的技術專長和產品能夠為QCMG極為重要的研究帶來顯著的生產力優勢。採用SGI公司的LiveArc的研究組織是一個成熟的圈子,QCMG加入其中將大幅改善本身的工作流程和研究資料追蹤。」

關於 SGI公司

SGI公司是大規模叢集運算、高效能儲存、HPC和資料中心可建置和服務的全球領導者。SGI公司專注於幫助客戶克服最嚴厲的業務及技術挑戰。進一步資訊,請瀏覽http://www.sgi.com.。

LiveArc是SGI公司與澳洲Arcitecta Pty. Ltd.的合作開發成果,與SGI公司的InfiniteStorage 解決方案一起銷售。

關於昆士蘭醫學基因組學中心

昆士蘭醫學基因組學中心 (QCMG) 由澳洲國立衛生與醫學研究委員會 (NHMRC)、昆士蘭州政府和昆士蘭大學 (UQ) 資助建立。該中心的旗艦課題是500個胰腺癌和卵巢癌的基因組測序,該課題是國際癌症基因組聯合體 (ICGC) 的組成部分。澳洲對 ICGC的承諾促成了這座世界級測序中心的創立,該中心設在昆士蘭大學的分子生物科學研究所 (IMB) 內。QCMG目前雇用了30多位分子生物學研究科學家和生物資訊科學家,致力於醫學基因組研究。進一步資訊,請瀏覽www.qcmg.org。

© 2010 SGI. SGI 和LiveArc是of Silicon Graphics International Corp.或其分公司在美國和/或其他國家的註冊商標或商標。其他所有商標分別是其對應權益人的財產。

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